无线传感器网络构架第二部分是运行于单片机或者无线单片机内部的嵌入式软件，也称软件协议栈（networkstack），网络堆栈有两个职责。首先它必须要处理节点间的无线链接通信质量的频繁变化和环境因数对无线通讯造成的干扰，具有对网络自组织，自恢复的能力；网络堆栈的第二个职能是要具有很强的路由算法能力，确保信息可靠高效地通过各种网络拓扑（星状/网状等等）从源节点（如果现有，可以通过成百上千路由节点）发送到目标节点。确保通讯的实时性要求。
ZigBee联盟是由众多技术供应商和开发商组成的独立标准组织。也是目前世界是最大的，基于IEEE802.15.4平台的网络软件协议栈标准提供联盟。
该组织从ZigBee2004、ZigBee2006、ZigBee2007不断发展，目前提供的两个网络栈是：ZigBee和ZigBeePRO。从使用角度看ZigBee堆栈很适合一般包含十到几百个节点的小型网络。而ZigBeePRO是ZigBee超集，它增加了一些功能，可对网络进行扩展并更好地应对来自其他技术的无线干扰，而且可以适应更大型的网络和具有更加可靠的路由通讯算法和无线通讯可靠性。
无线传感器网络构架第三部分应用软件，这部分包括各种根据用户现有开发的软件代码，这些代码目前大部分是采用C语言来进行开发，可以之间以接口和API方式，调用软件协议栈的功能.
在多种无线传感器网络技术中，我们认为采用802.15.4国际标准和ZigBee技术，作为我们设计无线传感器系统的起步，有如下优点：
1 兼容一个全球化的可靠的国际标准。
2 可以通过TI、Freescale这样的大型芯片供应商。获得稳定的无线收发芯片和无线单片机来源，也可以获得免费的ZigBee协议栈和相关源代码，降低开放门槛。
3 能够采用KEIL和IAR这样的高性能软件编译调试环境，可以大大加快开放速度，缩短上市周期。
