科技版诺亚方舟的中控室极其复杂，是其中枢神经，最重要的地方。它控制着方舟上的各项机能，包括动力系统、照明系统、通信系统、导航系统、防御系统等。对于一艘能够承载千余人的高科技诺亚方舟，而且还要抵御无法预知的大灾难，对中控室的要求就更高了。
虽然与传统的中控室有所区别，但其本质上还是有相通的地方。对于科技版诺亚方舟上的上位机，不再是一台简单的工控机了，而是由目前最先进的人工智能计算机组成的中央控制系统。人工智能计算机能理解人的语言，以及文字和图形。人无需编写程序，靠讲话就能对计算机下达命令，驱使它工作。人工智能计算机是把信息采集存储处理、通信和人工智能结合在一起的智能计算机系统。运用该系统既能起到工控机的作用，又能更快捷更有效的控制方舟的各项系统。另外，中控室除了控制各个重大系统以外，方舟上还有一些部分是直接由中控室控制，例如：方舟的进出舱门，以及方舟顶部和周围的通风口、窗口和活动出口等，这些地方都必须由中控室直接控制，不能随意打开。因为灾难的不可预知性，谁也不知道方舟外面是什么情况，灾难发生时或发生后，无法确定方舟周围的水或空气内是否含有有害物质或气体。所以一般情况下，这些出入口必须是全封闭式的，只有当中控室确定外部安全，才可打开。
灾难电影《2012》里诺亚方舟内的中控室
另外，中控室需要整艘方舟内的各大系统的运行情况都要在上位机上显示出来，通过中央控制系统对其各个系统进行指令控制。当方舟总指挥对某个系统下达指令，中央控制系统可以迅速的通知到该系统并提示其该做什么，而具体的执行则由该系统的人员进行。另外，当某系统出现问题，也会通过中央控制系统反馈到上位机，使得中控室能迅速掌握情况，并发出操作指令。这样就可以让方舟有一个统一的指挥中心，使方舟的各项功能能够井然有序的进行。